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e-cancer:がん全般 複数のがん種において高頻度にみられる「パッチ状」腫瘍

27 Apr 2021

Francis Crick Instituteの研究者らは、国際協力の一環として、全ゲノムの汎がん解析によりさまざまながん種に罹患した2,600人超の患者の腫瘍サンプルの全ゲノムを解析した。

彼らは、個々の腫瘍内の遺伝的多様性の高い有病率を特定し、特徴付けた。

彼らの発見は、発生の後期段階であっても腫瘍の進行はがんに利益をもたらす変化によって引き起こされることを確認している。

がん細胞が分裂すると、DNAをコピーする過程でエラーが発生する。
これらのコピーエラーは、さまざまな腫瘍が広範な遺伝的多様性を示す細胞で構成されている可能性があることを意味している。

サブクローンと呼ばれる遺伝的に関連する腫瘍細胞のある集団に対して有効な治療法は、別の集団に対しては効果がない可能性があるため、この多様性は医師にとっての課題となっている。また、特定のサブクローンは腫瘍の拡大や薬剤耐性を引き起こす可能性がある。

がん研究者らは、疾患進行のさまざまな時点で発生するこれらのサブクローンの進化を促すものを理解するために研究を続けている。

彼らの研究では38種類に及ぶがんについて2,658のがんサンプルの全ゲノムが解析され、Cell誌で発表された。

彼らは、サンプルの95%に少なくとも1つの識別可能なサブクローンが含まれていることを発見した。

彼らはまた、遺伝的変化のレベルと種類ががん種によって異なることを示した。

そして、同じ腫瘍でも、異なるサブクローンの遺伝子構成は大きく異なった。

研究者らは、これらのサブクローンは腫瘍増殖中のさまざまな時期に存在するか、または腫瘍のさまざまな部分に影響を与える特定の進化的圧力のために発生すると考えている。

例えば、免疫系を回避する場合のように特定の微小環境条件に耐性を得るためである。

この理論を支持するものとして、彼らはサブクローンの進化は遺伝的変化ががんのサブクローンに役立つか否かによって影響を受けるというエビデンスを発見した。有利なサブクローンが発達する可能性が高くなる。

本研究の著者であり、CrickのCancer Genomics LaboratoryのグループリーダーであるPeter Van Loo氏は次のように述べている。「がんは時間とともに絶えず変化しているので、腫瘍から採取されたサンプルは単一時点を反映しており、がんはこの後も進行し続けることを認識することが重要である。

それらは、さまざまな突然変異と進化的圧力によって促進される部分を持つパッチ状に発達する可能性がある。

「サブクローンの進化、サブクローンが一定方向に発達する理由、およびサブクローンがどれほど一般的であるかを理解することで、医師は特定のがん種に存在する可能性のある変動量と種類をより正確に予測できる」

この分野の研究は、この遺伝的多様性を理解することで、生存または再発率を予測できることをすでに示している。これは、医師や患者が重要な治療法を決定するのに役立つ可能性がある。

研究者らは、サブクローンで発見した遺伝的変異について論文化したオープンアクセスリソースを作成した。

それらの計算方法は、他者ががんゲノムを解析するためにも利用できる。

本研究の著者で、CrickのCancer Genomics LaboratoryのポスドクであるMaxime Tarabichi氏は、次のように述べている。「われわれは、これらの複雑な遺伝子データを解析するために、多くの高品質の計算方法を組み合わせた。

心強いことに、メソッドをさまざまな方法で組み合わせて、独立したシミュレーションにかけると、結果は常に同じストーリーに適合するという結果をもたらした」

https://ecancer.org/en/news/20025-patchwork-tumours-prevalent-across-multiple-cancer-types

(2021年4月8日公開)

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